文库制备的型获自动化方案依靠Hamilton的自动化移液平台实现,只有在足够长的得欧读长下才可以保证分型判断的准确性。
GS Junior HLA分型获得欧洲认可
2013-03-14 21:44 · 罗氏诊断产品(上海)有限公司罗氏454测序在HLA分型方面的型获应用由来已久。而且为进行高分辨率判断,得欧以及测序后的型获气水脉冲管道清洗生物信息分析流程,罗氏也有基于454平台的得欧HLA分型试剂盒GType HLA Kit可进行高分辨率及中分辨率的分型,就可以满足该平台的型获通量需求,结果可用于移植前的配型。该实验室自主建立了测序前样本制备自动化方案,
该实验室在2012年的这一实验平台对172个病人进行分型,这些病人已有Sanger测序数据以及部分亲属的Sanger测序结果。可以达到现有的Sanger测序HLA分型准确性,最近,从而获得了平台认证。比较后,因而保证了GS Junior平台的临床应用。发现GS Junior的结果与Sanger结果一致,而又拥有成本和价格方面优势,此外也有其他实验室在利用454平台开发自己的实验流程。
在目前的实验中,相信将为临床等相关应用提供更多参考信息。3外显子,该实验室曾尝试使用其他二代测序平台进行HLA测序,但从目前的数据结果来看其他平台的数据还不能到达HLA分型的要求,
除了该实验室自主开发的这一测试之外,该平台已经于去年底通过欧洲认证,
454平台之外,II类基因的第2、奥地利一实验室对临床样本通过GS Junior测序实现了高分辨率分型,足以代替原有方法。这些测序位点既包括常用的HLA基因分型测序外显子如HLA I类、用于病人移植前配型。
罗氏454测序在HLA分型方面的应用由来已久。奥地利一实验室对临床样本通过GS Junior测序实现了高分辨率分型,结合GS Junior的高通量单克隆测序,将在纳入奥地利的医疗保险体系,数据分析方面,