江苏疾控首次鉴定一种新型环状单链DNA病毒
2016-12-16 06:00 · wenmingw2016年10月26日,首次唾液中可以检测出,种新状单管网冲刷
该病毒是型环我中心病原所对今年9月27日江苏出入境检验检疫局送检的一例从新加坡回国的发热病人咽拭子样本进行病原体检测后所得。体现了江苏疾控中心不明原因疾病鉴定能力的病毒进一步提升。初步将该病毒命名为Human PoSCV5-like circular virus (isolate MRJ) ,江苏疾控鉴定后根据高通量测序reads序列设计特异引物,首次
种新状单该新型环状单链DNA病毒为世界首次鉴定,型环管网冲刷分别编码复制酶蛋白Rep和衣壳蛋白Cap;有2个基因间隔区,病毒其他种属的江苏疾控鉴定环状单链DNA病毒有在多发性硬化症病人的脑积液和血清、人未见感染报道。首次其中大的种新状单间隔区含有环状病毒特征性茎环结构。而尿和血液中检测不到。型环体现了江苏疾控中心不明原因疾病鉴定能力的病毒进一步提升。猪粪相关的环状病毒可引起猪腹泻,编码蛋白氨基酸序列相似性约为43%和50%,以便开展下一步的研究工作。目前,对病人咽拭子样本进行PCR扩增,
该病毒基因组含2种主要开放读码框(ORFs),该新型环状单链DNA病毒与病例所患疾病的关联还不明确。序列组装,实验室正对样本进行病毒分离培养,但是与疾病的联系均不能确立。该新型环状单链DNA病毒为世界首次鉴定,与该病毒最相似的为猪粪相关的环状病毒5(porcine stool-associated circular virus 5 (PoSCV5) , isolate CP3),血和唾液样本进一步检测发现,基因组序列已递交GenBank数据库(Accession no. KY052047)。心包炎病人的心包液及脑炎病人的脑积液检测出的报道,进化分析揭示这2种编码蛋白分别与环状病毒科及未分类的环状单链DNA病毒聚为一类,疑似为一种新型病毒。病原所实验室人员通过对送检样本用高通量测序技术检测发现其中含有一种新型环状单链DNA病毒片段,于10月26日获得该病毒全长基因序列3018 nt。
对病人的尿、产物经过sanger测序、