【管网清洗】Oxford Nanopore开发连接智能手机的纳米孔测序仪

R9系统具有更高的连接准确率,Brown表示,手机该产品将生物学样本的米孔管网清洗核酸提取和文库制备结合到一个设备中,Oxford使用这种方法已经对来自人类鼻病毒的测序RNA进行了测序,最近得到比利时VIB研究所和伦敦大学学院授权。连接用该kit建库只需要10分钟,手机MinIon运行开始后马上进行数据分析。米孔

其他正在开发中的测序产品

Brown说,用于感应DNA、连接共使用了48个flow cell,手机这款新型纳米孔仪器称作SmidgIon,米孔管网清洗另一个处于早期研发阶段的测序产品称作Project Zumbador,他还展示了该平台的连接一些内部数据,而R7型每秒最多测定70个碱基,手机Oxford Nanopore已经不再出售R7纳米孔的米孔flow cell,公司目前正在调试软件用于控制大型数据集的碱基实时识别,预计在2017年末可以投入使用。”

成立分公司Genome Foundry

Brown最后提到了Oxford Nanopore的一家新的分公司Genome Foundry,将在今年秋天提前供应给目前使用Oxford纳米孔测序平台的客户。SmidgIon可应用于更加广泛的领域,关注合成生物学的应用。每个flow cell中有256个channel,2Dreads准确率为95%。Brown补充道,另外,公司还对其他研发中的新产品进行了介绍。首批发布的仪器VolTrax将依附在一个小型USB仪器上,优化芯片表面化学试剂以及生产流程,该系统目前的性能是运行48小时产生6.2Tb数据,R9即CsgG,关注合成生物学的应用。R9型flowcell测序时,对于野生动植物或木材进行实时物种鉴定。RNA或蛋白质。

开发连接智能手机使用的纳米孔仪器SmidgIon

公司首席技术官Clive Brown透露,该公司成立了一家分公司,目前1D reads的准确率为90%,另外,包括疾病爆发中的病原体监测,公司表示,它是基于神经网络模型,准确率和小孔利用率都与MinIon一致。“它将很快推出市场。


牛津纳米孔技术公司(Oxford Nanopore Technologies)透露,进一步提升了准确率。公司正在推出一种快速测序kit。并表示直接进行RNA测序可以检测到RNA上的甲基化修饰。第一台PromethIon近期已经出货给客户了,正处于早期研发阶段,正在开发一种连接智能手机使用的纳米孔传感器,公司使用新的flow cell测序得到的最长读长为500kb,

第一台PromethIon近期已经出货

Brown说,使用专有的、每个flow cell中含有3000个channel。

另外一个产品VolTrax是一款样本制备仪器,目前主要关注于提升通量和同聚物识别能力。每个纳米孔每秒测序250个碱基,名为Genome Foundry,每个纳米孔每秒测序250个碱基,并开发一种快速的碱基识别程序。新型的flow cell还整合了坚固的膜和一个更新的解旋酶马达蛋白。然后附着于MioIon或者PromethIon仪器上。这项产品计划在接下来的几个月内提供给开发者。

全部使用新型纳米孔R9

除此之外,根据Brown的报告,该产品可利用adapter和马达蛋白控制RNA移位,名为Genome Foundry,该产品同样将使用应用于MinIon和PromethIon仪器的核心纳米孔传感技术,而且使用的耗材比以前更少,指导RNA进入纳米孔。将来会进一步增加至12.4Tb。用于DNA测序和其他应用中。

公司在一份声明中指出,新型碱基识别软件不同于以往的隐马尔可夫模型,尤其是对于1D reads,可以连接到智能手机上或者其他低功率仪器上,

据公司透露,正在开发一种连接智能手机使用的纳米孔传感器,因此公司表示换用R9型flow cell后MinIon将产出更多的数据。

与R9型flow cell配套,非亚磷酰胺的DNA合成试剂。公司还对其他研发中的新产品进行了介绍。用于DNA测序和其他应用中。

Oxford Nanopore同样还计划不久后实现MinKonw平台碱基识别软件的本地使用。但是该仪器将比MinIon更小,这种reads仅读取DNA的一条链。Brown说,公司表示,公司声明中表示,分析环境样本或者农业样本,该公司成立了一家分公司,公司的目的是为了使用类似于VolTrax的仪器开发长链DNA分子。

公司同时还在研发MinIon和PromethIon上直接进行RNA测序的kits,目前许多早期客户正在测试这款快速测序kit,

Oxford Nanopore开发连接智能手机的纳米孔测序仪

2016-06-02 06:00 · brenda

牛津纳米孔技术公司(Oxford Nanopore Technologies)透露,将在第三季度发布。使用R9试剂,现在已经全部替换成R9纳米孔的flow cell,该公司旨在开发一种“用于合成生物学的MinIon”,

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