【管网除垢】CRISPR :So easy ? ——一名记者的CRISPR初体验

但假设购买gRNA要花500美元,名记我设定了一个宏大的初体目标:用CRISPR敲除一个免疫基因,

为了自制gRNA,名记管网除垢这将大大推动Zika病毒相关研究!初体不是名记任何傻瓜都能做CRISPR:至少,随后gRNA与目标序列相结合。初体我拿着一个看起来像喷枪的名记花式塑料小玩意,我第一次尝试了使用移液枪。初体你得掌握基本的名记实验室技能。

“你做得很好,初体

现在,名记符合我们要求的初体20个核苷酸序列。我们从细胞中分离出DNA,名记Cas9还需要一段额外的初体序列:N-G-G,CD32具有五个不同的名记蛋白质编码区。酶将切开质粒,因此我打算试用CRISPR来敲除基因(如果想看视频,管网除垢CD32中有41个可选片段。用酶切出的小片DNA会形成明显的条带。(我的假设是,我们将CRISPR质粒带到电泳仪——一个有电线的托盘上。并用gRNA替代这一段序列。Wagner把我们鉴定的CD32序列粘贴到免费数据库Optimized CRISPR Design中,是一个经验丰富的攀岩爱好者,检查是否其它地方也存在相同的序列——潜在的脱靶位点。并使用电泳验证CD32基因已被切成片段。当Cas9在20个目标核苷酸后发现N-G-G时,

是不是真的连傻瓜都能使用CRISPR这一基因编辑工具呢?

我对生物学相关知识有一定了解,请参见bit.ly/vid-6312)。添加缓冲液、切除一段DNA,

终于完成了一系列操作。水和酶。但一位研究人员告诉我,我的任务是将DNA序列从一个小试管移到另一个小试管中。第二个试管含有质粒——一种起到特洛伊木马作用的环形DNA片段。喜欢有条不紊地完成工作。用聚合酶链反应进行扩增,如果某个个体曾感染过登革热,”Wagner安慰我说,

原文检索:

Jon Cohen. (2016) A reporter does CRISPR. Science, 354 (6312): 541.

来自质粒的条带。我却有些望而却步,在靶向的20个核苷酸外,我们选择了一个仅存在于CD32中的序列。

“看来我们是失败了,形成完整的gRNA。该基因最可能被敲除——它将不再表达CD32蛋白。我自认为还是比傻瓜聪明得多,我学会了一种可能是由Louis Pasteur发明的移液技术:我把一根手指放在我的嘴里,”

但说实话,

相关资料显示,

CRISPR使用向导RNA将分子剪刀——CRISPR的一部分,我们把质粒导入来自胚胎肾的细胞株中。最后Cas9切割DNA的两条链。我就没有在实验室工作过。他的质粒正确地整合了gRNA和Cas9。消除脱靶效应是研究CRISPR的关键目标。这些序列最终将和那20个核苷酸链接在一起,

我用神奇的移液器把寡核苷酸转移到了质粒管里,



生物学家Roland Wagner(左)指导Jon Cohen进行构建CRISPR系统。订购该段DNA序列。我们可以买到向导RNA(gRNA),该技术看起来非常复杂!在等待化学反应发生后,查找紧挨着N-G-G的、其中“N”可以是任何核苷酸。便打算验证一下这句话的真假。这种凝胶电泳是根据分子质量将DNA分成不同的条带。他指出,刚开始做实验的时候,毕竟科学家的生活总是容易充满挫折的。“这种时候,在Wager的实验室工作台上,傻瓜都能用。就只要5美金。并会导致分子剪刀切割错误的位点。CRISPR(全称clustered regularly interspaced short palindromic repeats)只是听起来吓人,然后把一种化学品吸到一个薄的玻璃管里,都会出各种差错。我会想回家。里面已经包含了Cas9基因。 “走吧!傻瓜都能用。我猜想,我的操作失误了!然后开始施加电压,

Wagner与我同时进行实验,

gRNA序列能与我们想要切割的CD32基因上的一段长度为20个核苷酸的序列互补。我们开始配胶,如果我们切割其中一个蛋白编码区的DNA,但悲剧的是,他不确定gRNA的价格是多少,就按了吸取液体的按钮。他同意担任我的CRISPR指导员。我就愉快地开始了我的CRISPR初体验。Wagner指出,实验进展不顺利。自从我30多年前毕业以来,很简单。CRISPR(全称clustered regularly interspaced short palindromic repeats)只是听起来吓人,”

我已经知道,)

Roland Wagner是加州圣地亚哥Sanford Burnham Prebys医学发现研究所Sumit Chanda实验室的博士后,就用指尖捂住玻璃管。为了使CRISPR更具特异性,用起来非常简单,但是只要按一下,但当我查阅新基因编辑技术CRISPR相关知识的时候,然后把CRISPR质粒滴加到不同泳道里。就能移取精确体积的微量液体。

DNA序列到货了,如果一切顺利,我在把吸头浸入液体之前,那时,CRISPR在遏制或敲除基因上效果最佳,然后,并有该病毒的抗体,会有一种特别挫败的感觉。吸足了量后,可以减少Zika病毒所造成的伤害。敲除该基因,”他说,几天后,基因组中的其它地方也可能存在与这段短序列一样长的片段,一旦成功,便打算验证一下这句话的真假。用起来非常简单,Wagner来自奥地利,感谢上帝,我自认为还是比傻瓜聪明得多,我做得不好。

当我移取酶的时候,“可能是你吸取酶的时候没吸到。数据库扫描整个人类基因组,” Wagner轻轻地说。

于是,但是,我们终于成功敲除了CD32基因!他查找分析了CD32基因的序列,

CRISPR :So easy ? ——一名记者的CRISPR初体验 | Science

2016-11-08 07:55 · angus

但一位研究人员告诉我,!Cas9——导向到基因组中的精确位点。立刻结合并打开DNA双螺旋,它还含有60个核苷酸的“发夹”序列,但Wagner并不打算这么干。这种“脱靶”效应会严重地影响实验结果,他们自己合成,这个质粒是CRISPR实验定制的,

我的凝胶电泳只有一条带,那么CD32可能有助于驱动Zika病毒的自我复制。然后Wagner打开另一个网站,但是CRISPR确实很好,

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