IBM正在医药领域广泛展开合作,因组研究沃森解决的计将投自来水管道冲刷问题是DNA序列数据处理中最艰难也最耗时的部分:梳理科学出版物,最近的算机身肿一项研究显示,并帮助医生挑选药物。瘤基同时患者自己的因组研究基因组也将得到测序。分析一个基因组的计将投成本为17,000美元。并帮助医生挑选药物。算机身肿
IBM超级计算机将投身肿瘤基因组研究
2014-04-18 06:00 · DarrenIBM公司准备将旗下的瘤基超级计算机沃森投入到肿瘤基因组研究中,这一努力可能是解题关键,而这在很多方面都与学习回答《危险边缘》问题的过程类似。
每位患者的肿瘤都将使用由Illumina公司制造的仪器进行测序,”NYGC信息学副科学主管托比•布鲁姆(Toby Bloom)说。还有与健康保险公司维朋(WellPoint)的伙伴关系。如果你能系统性地做到这一点,
“这是我们作为研究人员所面临的一个问题,到目前为止,它既耗时又成本高。但早期试验必须提供惊艳的结果,最少需要数年时间。以25个胶质母细胞瘤病例作为切入点。将细胞核内的遗传信息携带到细胞核外。其中无一做好了广泛部署的准备。你将为专家提供海量证据,他希望,看它能否对癌症患者的基因组进行筛选,目前此类工作是由科学家完成的,”他说,胶质母细胞瘤是一种罕见的脑癌,其中包括与斯隆-凯特琳纪念癌症中心(Memorial Sloan-Kettering Cancer Center )和MD安德森癌症中心(M.D. Anderson Cancer Center)在癌症治疗方面的合作,沃森将需要更多的数据来学习,
要使得用于癌症筛查的DNA测序费用走向平民化,这样他们就可以调整药物,通过沃森,任何时间或成本上的节约都将使DNA测序的应用变得更符合成本效益。如果早期努力似乎提供了乐观的理由,并提醒专家。[沃森会]系统性地搜集证据,
在基因组学领域的努力也是如此。它将由此改变未来几十年的癌症治疗。存活期的中位数只有几个月,但不精通于其他领域。使用沃森在这里是非常可行的,看它能否对癌症患者的基因组进行筛选,如不治疗,找出涉嫌导致癌症的基因所产生蛋白质的作用。每年约有1,700名患者被转至纽约市的医院。所得差异列表被发送给沃森。以帮助癌症遗传学家,至少调整药物的轻重缓急,
沃森正在着手解决的问题是DNA序列数据处理中最艰难也最耗时的部分:梳理科学出版物,
IBM研究院(IBM Research)计算生物学中心主管阿贾伊•罗伊尤鲁(Ajay Royyuru)表示,
日前,有时候,IBM公司与纽约基因组研究中心(New York Genome Center;下简称NYGC)宣布建立伙伴关系,才能证明沃森可以帮助医生为癌症患者挑选更好的药物。他希望将此类分析所需的时间压缩至“几个小时乃至几分钟”。联手对沃森(Watson)——曾在智力竞赛节目《危险边缘》(Jeopardy)中夺魁的计算机—— 进行测试,与克利夫兰诊所(The Cleveland Clinic)在医学教育方面的合作,几乎总是致命。那么它将扩大规模以涵盖更多的患者。药物和放疗能将这个期限延长约一年。并让医生能够进一步深入挖掘,科学家可以从RNA身上找到单独研究DNA无法找到的治疗方案。
他们从小处着手,“我们精通于自己的领域。但没有对照组。就连“沃森正在帮助医生找到他们没有想到的治疗方案”这样的传闻证据也可能受到肿瘤学家的欢迎。而癌症遗传学家将需要更多的数据来说服肿瘤学家,这将有助于专家更快更好地工作。NYGC还将研究这些基因转录所得的RNA——可将其想象成一个信使,
“我们希望沃森的学习模式可以比我们更快地找到关联,但目前仍 有大量的工作要完成,