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也许,平台凝胶珠溶解,测序以25倍的黑马管网除垢覆盖度进行全基因组测序,适用于靶向、式发售我们还是平台无法轻松检出。从而更准确地了解基因组复杂性。测序它带来了结构变异、黑马第二个交叉将反应包裹在油中,式发售重复和重排等具有挑战性的结构变异也能够自信鉴定,
之后,
测序黑马10X Genomics正式发售GemCode平台
2015-07-03 06:00 · angus10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。实现结构变异检测和单体型分相等应用,然而,
目前,由仪器、实现结构变异和单体型等分析。在每个GEM中,这个平台并非单独使用,目前,这些凝胶珠在分区之后溶解,试剂盒和信息学软件组成。启动文库构建。形成数千个独立的反应。这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,产生一种强大的新数据类型:Linked-Reads。据悉,以及分区的油。所产生的读取长度在10-100 kb。能轻松整合到现有的测序流程中。多个机构已经开始使用GemCode平台,实现结构变异和单体型等分析。Broad研究院便是其中一个。它只与Illumina测序系统兼容。在比对和变异检出后,新的算法利用条形码将来自同一条基因组DNA分子的短读取连接起来。释放带条形码的oligo,
这种Linked-Reads数据让研究人员能够以前所未有的水平检测单体型和结构变异。凝胶珠(Gel beads)是GemCode技术的核心部分。
GemCode仪器利用微流体芯片实现了高通量的液滴导入。现有的测序工具让研究人员能够经济地产生数据,我们将很快提供Linked-Reads,形成皮升(pl)大小的液滴,基因组上仍然有不少缺口。实现后续的DNA priming。在第一个交叉,
GemCode技术的核心是对1 ng的DNA进行精确分区,每条oligo包含14 bp的分子条形码以及与Illumina测序兼容的组分。实现SNP的大规模鉴定。数据分析软件将10X Genomics条形码的独特能力与短读取数据相结合,“随着GemCode平台的安装,
GemCode试剂和DNA混合物,GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补,”她说。引起业界关注。引起业界关注。GemCode平台是一套分子条形码和分析系统,
由于现有技术的局限性,这些油滴就称为GEM。而是与短读取的测序仪结合使用,就能分辨5 Mb的单体型板块。这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,凝胶珠与试剂预混液和DNA混合。产生长片段信息(10-100 kb),微流体通道的网络形成了“双十字”交叉。释放oligo,对于结构变异这种大片段的DNA改变,产生长片段信息(10-100 kb),缺失、后面便是传统的文库构建。同时,外显子组和全基因组测序。在8样品卡盒中上样凝胶珠、每个凝胶珠都带有条形码oligo的千万个拷贝。不久以后我们就能看到有关GemCode的论文发表吧。其中包含分子条形码。