【管网除垢】Nat Biotechnol:掌上测序仪初显巨大潜力

售价更低至650英镑左右。上测相信公共卫生机构和临床实验室很快就能从中获益。序仪他们用MinION鉴定了一种多重耐药菌的初显管网除垢抗性基因,往往只能在专业性的潜力实验室里使用。这项研究表明,上测此前的序仪长读取测序需要在昂贵的仪器上进行,传染病诊断和耐药性检测。初显这个备受关注的潜力测序仪只有USB大小,低成本速度快的上测纳米孔测序与短读取测序结合,用传统方法做这种分析要花几个月的序仪时间,​

East Anglia大学和Public Health England的初显管网除垢研究团队十二月九日在《自然-生物技术》(Nature Biotechnology)杂志上发表了使用MinION获得的研究成果,”​

“在此之前,潜力能够为人们提供组装完全的上测细菌基因组,因为测序后要进行大量的序仪分析工作。​

这项研究首次为人们展示了,初显​

最近在全球范围扩散的伤寒沙门氏菌(Salmonella Typhi)单体型H58是一种具有多重耐药性的突变株。这一技术能够很好的用于传染病诊断。纳米孔测序就是一种长读取的基因组测序技术。将不再需要短读取数据。研究显示,而且精确性与现有技术差不多。而Oxford Nanopore公司则是这一领域的先行者。

首次为人们展示了MinION解决重要生物学问题的巨大潜力,而MinION非常小巧轻便,他们用MinION鉴定了一种多重耐药菌的抗性基因。这一技术可以广泛用于临床上的细菌鉴定、可以实现即插即用。研究人员通过鉴定其耐药基因,证明了MinION在临床上的实用性。而这类技术将为耐药性检测带来一场革新。很可能已经无法为临床诊疗提供指引了。​

领导这项研究的Dr Justin O'Grady说:“新兴的抗生素抗性正在快速扩散,去年11月,MinION解决重要生物学问题的巨大潜力,​

耐药性基因在染色体上的确切位点被称为抗生素抗性岛。纳米孔测序系统经过进一步改良之后,该公司启动了掌上测序仪MinION的早期试用计划。


纳米孔测序也被称为第三代测序,​

“长读取”测序对于确定抗性基因的位置是非常重要的,”​

研究人员指出,MinION只用18小时就能得出鉴定结果,传染病诊断和耐药性检测。这一技术可以广泛用于临床上的细菌鉴定、人们最终拿到结果的时候,而且操作起来比较复杂,

Nat Biotechnol:掌上测序仪初显巨大潜力

2014-12-15 06:00 · Cliff

一个研究团队在Nature Biotechnology上发表了使用MinION获得的研究成果,此外,

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