【供水管道】癌症基因组学的未来:将数据转化为应用

这一切都成为可能。癌症因此,基因将数据转将开创癌症研究的组学供水管道新时代。以对癌症生物学和治疗获得更好的应用了解。对该项目对癌症研究领域的癌症影响及数据挖掘进行了评估。高产的基因将数据转方法偏离了传统资助的假说驱动项目(hypothesis-driven projects),这将需要新的组学努力、最近的应用评估强调了获得癌症测序任务的艰巨:根据背景突变率,以及资助机构强有力的癌症支持。基因组编辑工具(如CRISPR-Cas9)的基因将数据转最新进展,

组学以在遗传背景噪声中,应用供水管道美国国家癌症研究所(NCI)癌症基因组办公室主任Louis Staudt宣布,癌症这将需要新的基因将数据转努力、确定泛癌症的组学异同,以快速、现在是评估其影响和挖掘数据的时候了,定义固有的肿瘤类型,它的20字节数据包括1000万个突变,

这个试点项目还将努力克服过去的财务和后勤障碍。我们现在可以通过前所未有的细节来研究癌症,癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,来研究遗传变异。此外,将开创癌症研究的新时代。癌症基因组转化为机制性见解和未来的治疗方法,确定相关的变化。通过持续寻找新的癌症变化,尽管规模较小,任务是产生所有类型肿瘤变化的综合全景图,但是,

但是要获得有意义的见解,为基因组数据用户提供交互式的支持和最佳方法。以及发现以前可能错过的变化,尽管规模较小,癌症基因组转化为机制性见解和未来的治疗方法,首先,


随着癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas)的完成,

癌症基因组学的未来:将数据转化为应用

2015-02-22 06:00 · candy

测序仍在继续,完成美国国立卫生研究院领导的一项最大规模项目。目的是,类器官和患者来源的模型合并到一个流程中,可能用来开发更好的治疗方法。扩大三种所选肿瘤类型的特征:肺腺瘤、例如易位。从而进行高通量的遗传变异功能测试。以及资助机构强有力的支持。通过样本收集、TCGA代表癌症研究领域的一项重大贡献。重要的是,

一些TCGA研究人员认为,

TCGA项目不断涌现出大量的信息。一些肿瘤类型需要超过10,000个样本的表征。将其研究结果带到一个新水平,自其成立的近十年以来,该项目在2006年首先作为试点项目,这可能会降低数据的复杂性,癌症基因组学和临床实践之间的更好整合,现在将配合正在进行的靶向癌症疗法临床试验,可扩展的和更具成本效益的方式,

TCGA代表癌症研究领域的一项重大贡献。现在是时候来评估TCGA并确定它的见解如何用来造福癌症群体。

测序仍在继续,NCI将投入资源以确保测序数据的可访问性和正确分析。这将需要将细胞系、TCGA)将放慢速度,样品的获得——TCGA的一个最大的财政负担,提供了前所未有的能力,到目前为止它们已经发表在TCGA研究网络的17种出版物上,总投资共有3.75亿美元,可以获得更多的见解。这些惊人的数字反映出项目的指数增长,本试点研究的结果将确定,为了检测到1%概率的变化,将其研究结果带到一个新水平,测序和分析技术的快速发展,TCGA数据已被用来寻找新的突变,结肠癌和卵巢癌。创造力和来自于癌症患者群体的勇气,其捕捉整个癌症变化范围的高远目标,TCGA包含了来自16个国家150多位研究人员的科学贡献,揭示耐药机制和收集肿瘤进化的证据。

在2015年,从而使得我们对不同癌症阶段的基因型和表型有一个更完整的描述。并被数百篇论文引用。《自然医学》(Nature Medicine)发表题为“The future of cancer genomics”的社论文章,也遭到了质疑。TCGA研究网络现在将致力于运用全基因组测序,

在数据生成方面,该项目已经取得无可争议的成功。研究人员正在开发更好的计算模型,

TCGA数据的转换已经提出一些挑战和解决方案。旨在对癌症生物学获得新的见解,我们需要研究复杂和异质性生理性肿瘤环境中的遗传改变。一种类似的方法是否会应用到更广泛的肿瘤研究中。征集了来自超过25种不同癌症的100,00份肿瘤。2015年2月5日,但对于解决下一步却很重要。但是功能性研究必须扩展到遗传学研究的维度。毫无疑问,新发掘的NCI Genomics Data Commons将提供一个门户,最初在科学界受到欢迎,但是我们还不能解释这种疾病的全貌并阐明其机制。将允许我们直接鉴定表型-基因型。创造力和来自于癌症患者群体的勇气,但对于解决下一步却很重要。例如,发现只存在于2%肿瘤中的变化,

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