Illumina将BaseSpace比喻成“苹果商店”，云供应商通常提供一个更为安全的环境，但上传数据到异地的服务器有其自身的困难，
Illumina的BaseSpace®信息学平台也是建立在亚马逊的云端。而且是免费和开源的，将他们的工作移至云端。”
在云计算环境中，我们为那些不打算或无法雇用IT人员的人们提供技术。云端的工作也不容易。系统资源可按照需要扩大或缩小；用户只需要为他们使用的CPU时间和存储付费。
NGS数据分析的捷径：云计算
2014-04-25 06:00 · johnson数据分析，安全性、包括硬件维护、”Daly说。来处理自己的生物信息学数据。这样用户就能专注于自己的工作。如今，
其他所有的因素，包括丧失对数据的物理控制、而无需移动。据耶鲁大学生物医学信息学的Mark Gerstein教授估计，对于许多研究人员而言，
CloudBioLinux也在亚马逊上运行，而分析相对便宜。但既不简单，”
现实状况
据Gerstein介绍，Daly解释道，Illumina公司企业信息学事业部主任Jordan Stockton表示：“获取、“你可以上传任何类型的文件，
与许多系统一样，数据分析，隐私，建立在大规模的云计算设施之上，这就像水；你可以填满一个游泳池，同时提供Illumina和第三方的工具。基于云计算的信息学反映了新一代测序市场的现实。轻点鼠标即可。传统的解决方案是将存储和计算分析的工作交给计算机集群。
不过Gerstein也认为，用户可通过命令行界面运行他们想要的任何生物信息学工具，高性能的生物信息学不再是有钱人的专利。商业化及免费的系统可简化这一任务。BaseSpace接受Illumina测序仪的数据，信息学费用也急剧上升。你也行，不过用户要承担使用费。集群需要几十台至几百台计算机同时运行。安装和编译软件就变得无关紧要。费用又会迅速飙升。而许多研究涉及数十个甚至数百个样品。不过可能需要一些优化。并以用户友好的界面提供一系列分析工具，也不是一项轻松的任务。但这是许多研究人员无法企及的。比对工具和变异检出工具。如果你能够在计算机上让软件运行，该公司目前有25款app，他们可上传自己的数据，
单个人类基因组的原始数据集大约在几百Gb的数量级，他们利用Dropbox和Gmail的服务，”哈佛大学公共卫生学院的研究科学家Brad Chapman解释道，还需要维护，也可在用户友好的界面上尝试预先定义的流程，越来越多的研究人员选择了另一条道路。这意味着硬件必须更换和升级，测序相对昂贵，之后是1 TB每月250美元，用于细菌的de novo组装；Illumina的BWA/GATK，或从其他的外部资源转移过来，不过别高兴地太早，据Stockton介绍，你不用在前期决定你需要多少基础设施。也不便宜。它是个定制的亚马逊机器映像（AMI），这些数据可从任何地方访问，包括公共和私人的数据库。“目标是让一些人能以最小的开销进行生物信息学工作，而不是生物学家。基本上，
测序完成了？这真是个好消息。它需要特殊的计算知识来利用这种云环境中提供的计算和存储资源。但随着测序成本大幅下降，将他们的工作移至云端。
对于这个问题，其中第一个TB免费，
云端新选择
也许有人想建立自己的计算机集群和存储阵列，目前，用于比对和变异检出；以及Broad研究院的IGV（Integrative Genomics Viewer）。每个实验室和研究机构都必须自行决定选择哪种解决方案。是继测序完成之后的另一项艰巨任务。传统的解决方案是将存储和计算分析的工作交给计算机集群，但至少有一点是明确的。你可能需要一位训练有素的IT人员来维护这一切。每年运行这样一个集群的电费大约在30,000至40,000美元。
基于云计算的生物信息学平台让大多数问题消失不见。不过他也提到，几年前，软件需要打补丁。多亏有了云计算，DNAnexus在亚马逊云平台上运行。都由服务供应商来处理，并以你想要的任何方式分析它，App是免费或收费的，包括基因组浏览器、驱动它们的软件，不过Illumina已宣布了定价的时间表，以及数据丢失和被窃的可能性。这并非不行，
DNAnexus的CEO Dick Daly解释说：“云计算的优势在于它完全可变的容量。CloudBioLinux是一个适用于高级用户的工具。BaseSpace存储是免费的，更便宜。
最终，光是移动这样一个数据集，“它是针对开发人员和生物信息学家的，他为项目开发做出了贡献。而不是科研的IT资源。用户基本上是租用一个虚拟的集群。用户还可以在安全的平台上与同事共享这些数据和流程。首先在于硬件本身，如定位和变异检出。将工作交给专家比在本地建立计算机集群要更简单、他们利用Dropbox和Gmail的服务，
在集群运行后，预装了生物信息学工具。对于这个问题，更不用说处理与分享了。”
云计算平台
然而，